Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNH2Q12809 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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