Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAA2

LRRC74A, Leucine-rich repeat-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC74AQ0VAA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC74AQ0VAA2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC74AQ0VAA2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms