Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC15Q0P6D6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms