Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RBBP4Q09028 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP4Q09028 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms