Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBL2Q08999 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBL2Q08999 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms