Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPARAQ07869 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PPARAQ07869 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms