Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN1BQ07699 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms