Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FMODQ06828 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FMODQ06828 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FMODQ06828 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FMODQ06828 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FMODQ06828 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FMODQ06828 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FMODQ06828 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FMODQ06828 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FMODQ06828 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FMODQ06828 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FMODQ06828 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FMODQ06828 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FMODQ06828 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FMODQ06828 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FMODQ06828 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FMODQ06828 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FMODQ06828 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FMODQ06828 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FMODQ06828 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FMODQ06828 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FMODQ06828 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FMODQ06828 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FMODQ06828 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FMODQ06828 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms