Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYRO3Q06418 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TYRO3Q06418 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms