Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNB3Q05901 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms