Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN1Q05586 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN1Q05586 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms