Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTK2Q05397 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms