Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN12Q05209 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN12Q05209 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms