Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CFHR1Q03591 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CFHR1Q03591 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms