Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG1Q02413 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG1Q02413 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DSG1Q02413 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms