Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC1Q01954 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC1Q01954 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms