Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SATB1Q01826 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms