Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MC1RQ01726 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms