Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAT1AQ00266 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAT1AQ00266 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms