Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F8P98187 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP4F8P98187 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms