Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MRPS9P82933 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRPS9P82933 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms