Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITX1P78337 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX1P78337 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX1P78337 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX1P78337 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX1P78337 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX1P78337 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX1P78337 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX1P78337 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITX1P78337 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX1P78337 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX1P78337 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX1P78337 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX1P78337 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PITX1P78337 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PITX1P78337 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITX1P78337 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX1P78337 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX1P78337 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX1P78337 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX1P78337 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX1P78337 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX1P78337 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITX1P78337 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX1P78337 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX1P78337 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX1P78337 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX1P78337 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX1P78337 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX1P78337 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITX1P78337 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX1P78337 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX1P78337 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX1P78337 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX1P78337 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PITX1P78337 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITX1P78337 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITX1P78337 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITX1P78337 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITX1P78337 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITX1P78337 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PITX1P78337 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PITX1P78337 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITX1P78337 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms