Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS2P61201 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS2P61201 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS2P61201 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS2P61201 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS2P61201 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS2P61201 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS2P61201 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS2P61201 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS2P61201 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS2P61201 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS2P61201 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS2P61201 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS2P61201 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS2P61201 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS2P61201 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS2P61201 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms