Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX3P56589 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX3P56589 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX3P56589 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX3P56589 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX3P56589 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX3P56589 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX3P56589 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PEX3P56589 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX3P56589 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX3P56589 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX3P56589 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX3P56589 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX3P56589 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX3P56589 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX3P56589 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX3P56589 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX3P56589 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX3P56589 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX3P56589 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX3P56589 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX3P56589 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX3P56589 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX3P56589 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX3P56589 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX3P56589 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX3P56589 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX3P56589 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX3P56589 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX3P56589 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX3P56589 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX3P56589 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX3P56589 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX3P56589 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX3P56589 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX3P56589 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX3P56589 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX3P56589 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX3P56589 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX3P56589 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX3P56589 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX3P56589 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX3P56589 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX3P56589 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX3P56589 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX3P56589 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX3P56589 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX3P56589 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX3P56589 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX3P56589 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX3P56589 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms