Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NAP1L1P55209 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NAP1L1P55209 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms