Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A2P55011 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A2P55011 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A2P55011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A2P55011 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A2P55011 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC12A2P55011 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC12A2P55011 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A2P55011 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms