Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms