Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX2P52951 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBX2P52951 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX2P52951 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX2P52951 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX2P52951 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX2P52951 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBX2P52951 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBX2P52951 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GBX2P52951 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX2P52951 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX2P52951 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX2P52951 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX2P52951 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX2P52951 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX2P52951 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX2P52951 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX2P52951 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms