Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST1P52848 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST1P52848 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST1P52848 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST1P52848 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST1P52848 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST1P52848 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST1P52848 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDST1P52848 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDST1P52848 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDST1P52848 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDST1P52848 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDST1P52848 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST1P52848 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST1P52848 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST1P52848 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST1P52848 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST1P52848 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST1P52848 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDST1P52848 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDST1P52848 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDST1P52848 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDST1P52848 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDST1P52848 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDST1P52848 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDST1P52848 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDST1P52848 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDST1P52848 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDST1P52848 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDST1P52848 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDST1P52848 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDST1P52848 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDST1P52848 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDST1P52848 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDST1P52848 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDST1P52848 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDST1P52848 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDST1P52848 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDST1P52848 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDST1P52848 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDST1P52848 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDST1P52848 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDST1P52848 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDST1P52848 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDST1P52848 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDST1P52848 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDST1P52848 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDST1P52848 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms