Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms