Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN3P51790 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms