Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSEN1P49768 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSEN1P49768 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms