Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HARS2P49590 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HARS2P49590 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HARS2P49590 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HARS2P49590 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HARS2P49590 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HARS2P49590 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HARS2P49590 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HARS2P49590 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HARS2P49590 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HARS2P49590 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HARS2P49590 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HARS2P49590 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HARS2P49590 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HARS2P49590 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HARS2P49590 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HARS2P49590 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HARS2P49590 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HARS2P49590 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HARS2P49590 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HARS2P49590 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HARS2P49590 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HARS2P49590 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HARS2P49590 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HARS2P49590 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HARS2P49590 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HARS2P49590 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HARS2P49590 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HARS2P49590 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HARS2P49590 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms