Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMAN1P49257 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms