Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3P48764 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A3P48764 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms