Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC6A11P48066 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms