Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN1S1P47710 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN1S1P47710 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms