Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NKX2-1P43699 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms