Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSKP43235 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSKP43235 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSKP43235 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSKP43235 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSKP43235 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSKP43235 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSKP43235 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSKP43235 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSKP43235 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSKP43235 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSKP43235 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSKP43235 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSKP43235 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSKP43235 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSKP43235 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSKP43235 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTSKP43235 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSKP43235 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms