Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRATP43155 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRATP43155 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRATP43155 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRATP43155 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRATP43155 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRATP43155 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRATP43155 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRATP43155 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRATP43155 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRATP43155 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRATP43155 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRATP43155 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRATP43155 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms