Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSG1P42857 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSG1P42857 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSG1P42857 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSG1P42857 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSG1P42857 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSG1P42857 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NSG1P42857 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSG1P42857 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NSG1P42857 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NSG1P42857 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSG1P42857 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSG1P42857 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSG1P42857 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSG1P42857 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSG1P42857 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSG1P42857 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSG1P42857 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSG1P42857 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSG1P42857 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSG1P42857 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSG1P42857 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSG1P42857 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSG1P42857 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NSG1P42857 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSG1P42857 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSG1P42857 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSG1P42857 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSG1P42857 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.9 ms