Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF9P41273 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms