Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDH1P40925 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDH1P40925 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH1P40925 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH1P40925 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH1P40925 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH1P40925 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDH1P40925 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDH1P40925 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MDH1P40925 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDH1P40925 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDH1P40925 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDH1P40925 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH1P40925 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH1P40925 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH1P40925 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH1P40925 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH1P40925 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH1P40925 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDH1P40925 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDH1P40925 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms