Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK1P39086 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms