Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDFT1P37268 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms