Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT2P35908 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT2P35908 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT2P35908 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT2P35908 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT2P35908 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT2P35908 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT2P35908 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT2P35908 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT2P35908 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT2P35908 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT2P35908 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT2P35908 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT2P35908 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT2P35908 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT2P35908 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT2P35908 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT2P35908 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT2P35908 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT2P35908 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT2P35908 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT2P35908 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT2P35908 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT2P35908 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT2P35908 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT2P35908 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT2P35908 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT2P35908 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT2P35908 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT2P35908 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT2P35908 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT2P35908 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT2P35908 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT2P35908 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT2P35908 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT2P35908 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT2P35908 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT2P35908 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT2P35908 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT2P35908 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT2P35908 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT2P35908 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT2P35908 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT2P35908 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT2P35908 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT2P35908 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT2P35908 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT2P35908 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT2P35908 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms