Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMI1P35226 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMI1P35226 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMI1P35226 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMI1P35226 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMI1P35226 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BMI1P35226 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BMI1P35226 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BMI1P35226 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BMI1P35226 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BMI1P35226 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BMI1P35226 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BMI1P35226 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BMI1P35226 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BMI1P35226 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BMI1P35226 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms