Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HSPA4P34932 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSPA4P34932 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms