Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NTF4P34130 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF4P34130 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF4P34130 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF4P34130 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF4P34130 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF4P34130 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF4P34130 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF4P34130 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF4P34130 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTF4P34130 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTF4P34130 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTF4P34130 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NTF4P34130 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTF4P34130 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTF4P34130 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF4P34130 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF4P34130 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF4P34130 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF4P34130 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF4P34130 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF4P34130 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF4P34130 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NTF4P34130 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF4P34130 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF4P34130 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF4P34130 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF4P34130 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF4P34130 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms