Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTX2P32243 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTX2P32243 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTX2P32243 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTX2P32243 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTX2P32243 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
OTX2P32243 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTX2P32243 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTX2P32243 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTX2P32243 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTX2P32243 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTX2P32243 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OTX2P32243 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
OTX2P32243 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
OTX2P32243 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OTX2P32243 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms